Kot somalijski może zachorować tak samo jak każde inne stworzonko. Warto, więc zapoznać się z potencjalnym zagrożeniem, jakie na niego czyha. Jedna z takich chorób jest chlamydioza. Jest to zaraźliwa choroba bakteryjna, która jest powodem wielu chorób układu oddechowego. Może także dojść do zarażenia nią człowieka.
Najprostszą droga zarażenia jest kontakt zwierzęcia z kałem, w którym grasuje bakteria. Jeżeli zostanie już zdiagnozowana u kota, powinien zostać zastosowany antybiotyk w postaci kropli do oczu. Aby zapobiec ewentualnemu zakażeniu, można zastosować dostępną szczepionkę, która jest połączona z antygenami zapobiegającymi różnym chorobom wirusowym. Bardziej narażone na tę chorobę będzie kot somalijski, który przebywa w większych skupiskach, w których może mieć kontakt z zakażonym kałem. Koty typowo domowe raczej nie powinny się zarazić, chyba, że zetkną się z odchodami, które został np. na butach.